v***a 发帖数: 1242 | 1 需要某蛋白激酶在我培养的细胞里过量表达,筛选plasmid constructs时测序是正确的
,不过大量培养后得到很多的DNA拿去测序,好像说质量不好,测序结果就没有太较真。
然后就transfect我培养的细胞,取得cell lysate做western blot,发现蛋白表达量对
照vector的control基本无变化。以前我也在相同的细胞里overexpress过一个蛋白,
work得都还好。我应该怎么做,才能用western blot看到蛋白表达量的变化呢?谢谢! |
m*********n 发帖数: 215 | 2 重新转化,挑单克隆然后测序。如果你的插入序列是pcr来的话,测序需要设计primer
把插入序列的全场都测过。还有你用的细胞系内源表达此担保么? |
S******e 发帖数: 393 | 3 个人几点想法:
1)confirm constructs 正确
2) 质粒最好纯度要高,至少不要太差
3)转化效率要高
如果蛋白较大,转染后即使有表达(比如检测tag), 但量不够,
这时用内源蛋白抗体检测时就不一定能看到差异,正如你所说的与control比没变化。
如果你的构建加tag了,就检测一下看是否已表达了,若已表达那就想办法提高转化效
率吧。
(另外还想到的是加inducible 的promoter诱导时间长一些,不知是不是可行,仅供参
考) |
v**********m 发帖数: 5516 | 4 现实和理想是有差距的,不是没有恋曲都有美好结局。
你的蛋白可能压根就表达后不稳定或不表达。
真。
【在 v***a 的大作中提到】 : 需要某蛋白激酶在我培养的细胞里过量表达,筛选plasmid constructs时测序是正确的 : ,不过大量培养后得到很多的DNA拿去测序,好像说质量不好,测序结果就没有太较真。 : 然后就transfect我培养的细胞,取得cell lysate做western blot,发现蛋白表达量对 : 照vector的control基本无变化。以前我也在相同的细胞里overexpress过一个蛋白, : work得都还好。我应该怎么做,才能用western blot看到蛋白表达量的变化呢?谢谢!
|
v***a 发帖数: 1242 | 5 昨天重新测序了,全对。不过stop codon “TAA”的最后一个“A”未测出来,这个应
该不要紧吧?我的细胞是primary cells,我把plasmid转染进细胞,进行transient
overexpression。
primer
【在 m*********n 的大作中提到】 : 重新转化,挑单克隆然后测序。如果你的插入序列是pcr来的话,测序需要设计primer : 把插入序列的全场都测过。还有你用的细胞系内源表达此担保么?
|
v***a 发帖数: 1242 | 6 谢谢!
我的蛋白没有tag,就是用抗此蛋白激酶的抗体看表达。这个蛋白本身在basal level下
用抗体看WB都蛮清楚的,看不出来差异会和此有关吗?
重新测序全对(除去终止子最后一个未得到confirm),质粒的纯度还行,A260/A280是
1.746,A260是0.365 AU。
提高转化效率有哪些方法呢?
【在 S******e 的大作中提到】 : 个人几点想法: : 1)confirm constructs 正确 : 2) 质粒最好纯度要高,至少不要太差 : 3)转化效率要高 : 如果蛋白较大,转染后即使有表达(比如检测tag), 但量不够, : 这时用内源蛋白抗体检测时就不一定能看到差异,正如你所说的与control比没变化。 : 如果你的构建加tag了,就检测一下看是否已表达了,若已表达那就想办法提高转化效 : 率吧。 : (另外还想到的是加inducible 的promoter诱导时间长一些,不知是不是可行,仅供参 : 考)
|
S******e 发帖数: 393 | 7 当时我转的蛋白较大,检测tag可以看到表达,但用蛋白本身抗体检测就看不大出来差
异,说明表达量还不够高。
MCS后一般有stop condon, 所以你的stop condon 没测出来应该没大问题。
我做transfection的质粒一般A260/280 是大于等于1.9, Qiagen kit prep.
plasmid浓度最好1ug/ul 以上。
我觉得你看不到差异的原因很可能是表达量还不够,但你没有tag也没法检测它是否已
表达,你把效率提上去再检测看看,我觉得还是很有希望。
提高转化效率也是我一直的问题,但我估计我转的质粒比你大,我前几天在这问过这个
问题。 你先用脂质体方法试两次,LTX或lip2000, 若还不行,建议你再try电转,据说
效率高出很多。
【在 v***a 的大作中提到】 : 谢谢! : 我的蛋白没有tag,就是用抗此蛋白激酶的抗体看表达。这个蛋白本身在basal level下 : 用抗体看WB都蛮清楚的,看不出来差异会和此有关吗? : 重新测序全对(除去终止子最后一个未得到confirm),质粒的纯度还行,A260/A280是 : 1.746,A260是0.365 AU。 : 提高转化效率有哪些方法呢?
|
S******e 发帖数: 393 | 8 另外,如果你的基因不是特别大,改用lentivirus,也是一个不错的选择。 |
K*o 发帖数: 96 | 9 有可能是降解太快了,你下次做Transfection的时候,多做一个孔,然后在收细胞前6
个小时加MG132。看看如果抑制降解这个蛋白是不是就能在Western上看到了。
我自己就曾经遇到一摸一样的问题,troubleshooting这个那个的,白费了我好大功夫
。 |
v***a 发帖数: 1242 | 10 真是非常感谢!可以问一下,MG132的工作浓度你大概用怎么一个范围?那以后做超量
表达的时候是不是都要以MG132的treatment作为基础了?如果对其它因素有影响,怎么
来区分是不是因为使用了MG132的缘故呢?
6
【在 K*o 的大作中提到】 : 有可能是降解太快了,你下次做Transfection的时候,多做一个孔,然后在收细胞前6 : 个小时加MG132。看看如果抑制降解这个蛋白是不是就能在Western上看到了。 : 我自己就曾经遇到一摸一样的问题,troubleshooting这个那个的,白费了我好大功夫 : 。
|
K*o 发帖数: 96 | 11 我一般用的是10mM. 只能用几个小时,过夜的话,细胞就都全死光了。
所以不能在试验的时候加MG132.不过如果你发现确实是因为蛋白降解太快导致的话,只
能Mutate关键位点,让它变稳定些。 |