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Biology版 - 为啥做overexpression却检测不到蛋白过量表达?
相关主题
有用ABI3130 测序系统自己测序的兄弟姐妹么?我都急死了。Question: If I wanna perform flow-cytometry to check function of a gene...
用qPCR检测mRNA,高1000倍,却看不到蛋白有没有蛋白本身是高度ubiquitinated的?
RT-PCR求助再问泛素化问题
DNA quality for SNP genotypingflag tag 难以检测到
color of DNA pelletMG 132 和cycloheximide 到底有啥用? 哪位大神解释一下?
怎么区分 RNA and cDNA关于小鼠组织内源蛋白western的问题
RNA中有DNA 污染的话能否用nanodrop等类似仪器测出?Re: Q about transfected protein localization
求助: 大家有没有遇到过这样的问题?请教给动物注射plasmid DNA的问题
相关话题的讨论汇总
话题: 蛋白话题: 表达话题: 检测话题: 细胞话题: 测序
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v***a
发帖数: 1242
1
需要某蛋白激酶在我培养的细胞里过量表达,筛选plasmid constructs时测序是正确的
,不过大量培养后得到很多的DNA拿去测序,好像说质量不好,测序结果就没有太较真。
然后就transfect我培养的细胞,取得cell lysate做western blot,发现蛋白表达量对
照vector的control基本无变化。以前我也在相同的细胞里overexpress过一个蛋白,
work得都还好。我应该怎么做,才能用western blot看到蛋白表达量的变化呢?谢谢!
m*********n
发帖数: 215
2
重新转化,挑单克隆然后测序。如果你的插入序列是pcr来的话,测序需要设计primer
把插入序列的全场都测过。还有你用的细胞系内源表达此担保么?
S******e
发帖数: 393
3
个人几点想法:
1)confirm constructs 正确
2) 质粒最好纯度要高,至少不要太差
3)转化效率要高
如果蛋白较大,转染后即使有表达(比如检测tag), 但量不够,
这时用内源蛋白抗体检测时就不一定能看到差异,正如你所说的与control比没变化。
如果你的构建加tag了,就检测一下看是否已表达了,若已表达那就想办法提高转化效
率吧。
(另外还想到的是加inducible 的promoter诱导时间长一些,不知是不是可行,仅供参
考)
v**********m
发帖数: 5516
4
现实和理想是有差距的,不是没有恋曲都有美好结局。
你的蛋白可能压根就表达后不稳定或不表达。

真。

【在 v***a 的大作中提到】
: 需要某蛋白激酶在我培养的细胞里过量表达,筛选plasmid constructs时测序是正确的
: ,不过大量培养后得到很多的DNA拿去测序,好像说质量不好,测序结果就没有太较真。
: 然后就transfect我培养的细胞,取得cell lysate做western blot,发现蛋白表达量对
: 照vector的control基本无变化。以前我也在相同的细胞里overexpress过一个蛋白,
: work得都还好。我应该怎么做,才能用western blot看到蛋白表达量的变化呢?谢谢!

v***a
发帖数: 1242
5
昨天重新测序了,全对。不过stop codon “TAA”的最后一个“A”未测出来,这个应
该不要紧吧?我的细胞是primary cells,我把plasmid转染进细胞,进行transient
overexpression。

primer

【在 m*********n 的大作中提到】
: 重新转化,挑单克隆然后测序。如果你的插入序列是pcr来的话,测序需要设计primer
: 把插入序列的全场都测过。还有你用的细胞系内源表达此担保么?

v***a
发帖数: 1242
6
谢谢!
我的蛋白没有tag,就是用抗此蛋白激酶的抗体看表达。这个蛋白本身在basal level下
用抗体看WB都蛮清楚的,看不出来差异会和此有关吗?
重新测序全对(除去终止子最后一个未得到confirm),质粒的纯度还行,A260/A280是
1.746,A260是0.365 AU。
提高转化效率有哪些方法呢?

【在 S******e 的大作中提到】
: 个人几点想法:
: 1)confirm constructs 正确
: 2) 质粒最好纯度要高,至少不要太差
: 3)转化效率要高
: 如果蛋白较大,转染后即使有表达(比如检测tag), 但量不够,
: 这时用内源蛋白抗体检测时就不一定能看到差异,正如你所说的与control比没变化。
: 如果你的构建加tag了,就检测一下看是否已表达了,若已表达那就想办法提高转化效
: 率吧。
: (另外还想到的是加inducible 的promoter诱导时间长一些,不知是不是可行,仅供参
: 考)

S******e
发帖数: 393
7
当时我转的蛋白较大,检测tag可以看到表达,但用蛋白本身抗体检测就看不大出来差
异,说明表达量还不够高。
MCS后一般有stop condon, 所以你的stop condon 没测出来应该没大问题。
我做transfection的质粒一般A260/280 是大于等于1.9, Qiagen kit prep.
plasmid浓度最好1ug/ul 以上。
我觉得你看不到差异的原因很可能是表达量还不够,但你没有tag也没法检测它是否已
表达,你把效率提上去再检测看看,我觉得还是很有希望。
提高转化效率也是我一直的问题,但我估计我转的质粒比你大,我前几天在这问过这个
问题。 你先用脂质体方法试两次,LTX或lip2000, 若还不行,建议你再try电转,据说
效率高出很多。

【在 v***a 的大作中提到】
: 谢谢!
: 我的蛋白没有tag,就是用抗此蛋白激酶的抗体看表达。这个蛋白本身在basal level下
: 用抗体看WB都蛮清楚的,看不出来差异会和此有关吗?
: 重新测序全对(除去终止子最后一个未得到confirm),质粒的纯度还行,A260/A280是
: 1.746,A260是0.365 AU。
: 提高转化效率有哪些方法呢?

S******e
发帖数: 393
8
另外,如果你的基因不是特别大,改用lentivirus,也是一个不错的选择。
K*o
发帖数: 96
9
有可能是降解太快了,你下次做Transfection的时候,多做一个孔,然后在收细胞前6
个小时加MG132。看看如果抑制降解这个蛋白是不是就能在Western上看到了。
我自己就曾经遇到一摸一样的问题,troubleshooting这个那个的,白费了我好大功夫
v***a
发帖数: 1242
10
真是非常感谢!可以问一下,MG132的工作浓度你大概用怎么一个范围?那以后做超量
表达的时候是不是都要以MG132的treatment作为基础了?如果对其它因素有影响,怎么
来区分是不是因为使用了MG132的缘故呢?

6

【在 K*o 的大作中提到】
: 有可能是降解太快了,你下次做Transfection的时候,多做一个孔,然后在收细胞前6
: 个小时加MG132。看看如果抑制降解这个蛋白是不是就能在Western上看到了。
: 我自己就曾经遇到一摸一样的问题,troubleshooting这个那个的,白费了我好大功夫
: 。

K*o
发帖数: 96
11
我一般用的是10mM. 只能用几个小时,过夜的话,细胞就都全死光了。
所以不能在试验的时候加MG132.不过如果你发现确实是因为蛋白降解太快导致的话,只
能Mutate关键位点,让它变稳定些。
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