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Biology版 - 问一个RNAi knockdown mRNA的问题
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RNAi knockdown选择shRNA的序列,用哪一种软件比较可靠?
做RNAi 的时候,能不能把三个shRNA的lentivirus同时感染?shRNA screening, Constructive advice needed
为什么我的shRNA knockdown导致靶向基因上调了20倍?mRNA降解是从5'端开始还是3’端开始还是从中间开始的?
现在发文章还需要2套siRNA吗?关于RNAi Knockdown的efficiency
今天AACR年会Dr。Pandolfi的报告令人印象深刻3T3 transfection效率太低
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相关话题的讨论汇总
话题: mrna话题: rnai话题: shrna话题: knockdown话题: 表型
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d******r
发帖数: 124
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一般来说,RNAi是降解整个mRNA,还是其中拥有同源序列的那部分mRNA?其他部分仍然
能转译表达?我用两个shRNA降解同一个基因,但是得到的表型却完全相反。有没有可
能是因为这两个shRNA降解了不同的exon,形成了不同功能的片段?
b**********8
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在大牛们出现之前我先抛个砖
我觉得要完全准确的回答你的问题,必须针对两个不同的shRNA做rescue实验,rescue
实验能说明至少两个问题:
1)两种完全相反的表型中,到底哪一种才是你的目的基因真正负责的表型;
2)在1)的基础上,进一步确定引起另一种无关表型的shRNA是否有脱靶效应。
d******r
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一般来说,RNAi是降解整个mRNA,还是其中拥有同源序列的那部分mRNA?其他部分仍然
能转译表达?我用两个shRNA降解同一个基因,但是得到的表型却完全相反。有没有可
能是因为这两个shRNA降解了不同的exon,形成了不同功能的片段?
b**********8
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在大牛们出现之前我先抛个砖
我觉得要完全准确的回答你的问题,必须针对两个不同的shRNA做rescue实验,rescue
实验能说明至少两个问题:
1)两种完全相反的表型中,到底哪一种才是你的目的基因真正负责的表型;
2)在1)的基础上,进一步确定引起另一种无关表型的shRNA是否有脱靶效应。
c****g
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赞楼上的说法!其实再弄几对shRNA看看如何,脱靶真致命!
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请教:L929 细胞外援表达和knockdown今天AACR年会Dr。Pandolfi的报告令人印象深刻
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