由买买提看人间百态

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全部话题 - 话题: rnai
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w******e
发帖数: 1187
1

the current regimen of RNAi can at least last for a week, at least that's
what ppl claimed. that seems to be a reasonable price to pay for something
w/ NO alternative treatment bah(again, how else do we increase sth?)
w***a
发帖数: 4361
2
是啊,gene therapy老是用病毒做载体,听起来就很扯。
RNAi delivery虽然现在也挺扯,但是至少大家都不考虑virus vector,另外RNA不存在
整合genome的问题,安全性要好很多。

1kb
d******e
发帖数: 1424
3
I think this is something about the current investment environment. Five
years back, Alnylam could get millions from Novartis just for some early
stage staff. Three years back, Merck would offer 1.1 billion for Sirna. Now
it is totally different. Big pharma will not easily open their pocket unless
they see pormising clinical programs.
I think this a NO vote from Roche on RNAi drug discovery in near future. But
when there is promise, they will surely come back.

还有
s******s
发帖数: 13035
4
来自主题: Biology版 - 弱问:genome-wide RNAi Screening
有人做好了,都是trangenic rnai,robot操作的,普通实验室就不要想了
K**********e
发帖数: 188
5
来自主题: Biology版 - 弱问:genome-wide RNAi Screening
得有一个机器人才行。
我们实验室有4个课题是这样的,动不动老板就叫嚣要把全基因组RNAi筛一遍。针对每
个基因都有3个不同的siRNA。除了针对基因的,也有针对小RNA的库
还分成很多sub库,比如跟细胞周期有关的库,跟damage有关的 等等。并不一定每次都
得筛2万多基因
c********r
发帖数: 1125
6
来自主题: Biology版 - 弱问:genome-wide RNAi Screening
俺们实验室原来的那个就是siRNA的genome RNAi筛选,有机械臂。
但是我觉得前期的优化和后期的数据处理都是问题。比如设计好的程序来尽量减少假阳
性,总之需要一定编程能力的人是最好,否则只能针对一些很简单的表形。
比如今年nature有一篇EMBL的mitocheck的那个筛选,人力物力巨大,但是我们组至少
就发现他们在某些表形上漏了很多candidates。。。当然没有完美的东东啦。。
后期数据处理分析需要服务器,数据库等等。。。总之需要的技术支持不少。
那个筛选开始的时候我们学校还没有BIO-screen facility center,所以所有的程序优
化,数据处理基本都是一个PHD做的。。。
现在学校有辅助中心了,工作量小了很多,他们也买了很多LIBRARY,药物的,化合物的
,部分基因组的等等。
当然最重要的还是要有钱。。。老板当年为了做这个筛选四处要钱都抓狂了。。。我还
记得我刚进实验室的时候老板跟我说:"靠,现在总算有钱来实施我的雄伟计划X了。。
哦哈哈哈"...汗
w******e
发帖数: 1187
7
来自主题: Biology版 - RNAi 不行了?
oops... thx for sharing~ still, I'm not sure whether it's
specifically against RNAi, or a cut across the industry
j**e
发帖数: 582
8
http://www.sciencemag.org/content/333/6047/1307.full
Multi-Input RNAi-Based Logic Circuit for Identification of Specific Cancer
Cells
Is it really possible now to design a man-made switch to control a cell?
d******r
发帖数: 124
9
来自主题: Biology版 - 问一个RNAi knockdown mRNA的问题
一般来说,RNAi是降解整个mRNA,还是其中拥有同源序列的那部分mRNA?其他部分仍然
能转译表达?我用两个shRNA降解同一个基因,但是得到的表型却完全相反。有没有可
能是因为这两个shRNA降解了不同的exon,形成了不同功能的片段?
d******r
发帖数: 124
10
来自主题: Biology版 - 问一个RNAi knockdown mRNA的问题
一般来说,RNAi是降解整个mRNA,还是其中拥有同源序列的那部分mRNA?其他部分仍然
能转译表达?我用两个shRNA降解同一个基因,但是得到的表型却完全相反。有没有可
能是因为这两个shRNA降解了不同的exon,形成了不同功能的片段?
z****u
发帖数: 1007
11
tetO driven, 表达某个gene的RNAi序列来knock down 其表达。
至少在Jax没有这样的老鼠。 是为啥呢。knockdown 的效率不够高导致没有phenotype?
有谁懂的讲讲?
Z**********g
发帖数: 222
12
http://www.cell.com/abstract/S0092-8674%2811%2900249-2
RNAi transgenic 老鼠可设计成inducible的,这样也就可reversible了。而knockout是无法reversible。
a*****g
发帖数: 543
13
More trouble than KO
1) efficiency is variable.
2) when you get efficient knockdown and beautiful phenotype, the interpretat
ion is much more complicated。
“Gene A knockdown causes developmental defects?”
while the more accurate discription will be "a short nucleotide targeting ge
ne A (and MANY OTHER GENES!) causes phenotype."
Given the time and money spent to generate a mouse model, the RNAi-in vivo s
ystem is not worth it...
Plus there is an international effort to produce conditional knockout... 阅读全帖
s******y
发帖数: 28562
14
来自主题: Biology版 - 问个RNAi的问题
对,注意买来的expression vector 最好是 RNAi insensitive 的。
比方说如果在老鼠里做就买个人的基因。
s********d
发帖数: 103
15
来自主题: Biology版 - Re. RNAi 抗癌药
以前我用过RNAi,一直认为进入细胞及有效抑制性和毒性是两个不可能解决的问题。有
人参与这个Trial吗,给讲一讲。
b******n
发帖数: 4225
16
这事情感觉不靠谱
RNAi特异性太高,昆虫突变一下就能resistant了
一个蛋白,90%以上的aa都是可变的(不影响功能)
h**********t
发帖数: 545
17
理論上是這樣的,但是實際上用於作用的dsRNA長度很長,被Dicer切碎後只要有一個片
段function,還是能起作用的。這也是我在學術會議上聽別人說的。
有人用RNAi轉基因作物去喂蟲子,餵了好多代,也沒有篩出抗性種群
y***i
发帖数: 11639
18
人的genome有 30亿个base pair,哪里能说避免就避免的。而且每个人的genome又不
同。和一个人的基因不吻合不意味着和别人的基因不吻合。。。。
我一向支持转基因,不过这个RNAi转基因我现在还真不敢支持。。。。

hairpin
的代
不能
h**********t
发帖数: 545
19
所以敢的就是时间差,万一分子生物学全民普及了,RNAi转基因就别混了
C**S
发帖数: 522
20
昆虫得吃多少才能被RNAi杀死?
f*******u
发帖数: 3102
21
实验材料当时没有保存,现在重新做的话也不是不可以,比较费事,想跟reviewer解释
怎么说比较好阿
另外用该基因的antibody验证过RNAi的表型,两者是一致的,可以说明问题么?
b********e
发帖数: 50
22
RNA即使降低了mRNA水平,也不一定会降低蛋白表达水平。当时做RNAi的时候也应该做
western blot了吧。如果没有这个结果,reviewer 那里肯定通不过。这个要求非常合
理。
f*******u
发帖数: 3102
23
因为没有现成的抗体,抗体要自己制备,当时刚开始做knock down的时候还没有拿到抗体
就没有办法做western.
好多RNAi带有western blot的文章用的都是siRNA吧,都是动物细胞什么的,有现成抗体
容易做点.
像我们这类我看到好多也不做western,就只有qPCR的data,估计是review不要求也就算
了,这要求了就不知道改怎么解释不做,
t******y
发帖数: 716
24
来自主题: Biology版 - 有谁知道如何block RNAi
最近做实验发现两个基因相互影响对方的表达(RNA, Protein),似乎有一个miRNA在
调节这两个基因的mRNA的稳定性和翻译。打算把RNAi block掉,导致miRNA不再起作用
。不知道有人做过这方面的试验?有没有好的建议?
谢谢
s******s
发帖数: 13035
25
来自主题: Biology版 - 有谁知道如何block RNAi
应该预测是啥microRNA不难吧?然后再针对性的做。
你把RNAi全block掉,太多性状改变了
s******a
发帖数: 472
26
http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature1
RNAi screens in mice identify physiological regulators of oncogenic growth
a***y
发帖数: 19743
27
求推荐
请问有什么好的方法在macrophage或neutrophil里做RNAi?
显然,做这种都希望快,省时,容易……。
orz跪求建议啦!
g*****n
发帖数: 250
28
来自主题: Biology版 - RNAi治疗很容易了吗?
基因治疗的垮台早已表明RNAi没有前景,但是人们仍然要忽悠。
干细胞治疗还可以苟延残喘几年。
至于Biotech industry,某些方向会消声灭迹,但是,总体上还是会很强。忽悠的东西
总会不断出现。
z*******a
发帖数: 175
29
来自主题: Biology版 - CRISPR会不会取代 RNAi呢?
RNAi在organism level 有用吗?
x********e
发帖数: 35261
30
来自主题: Biology版 - CRISPR会不会取代 RNAi呢?
这个的好处主要是genome editing吧 RNAi都差不了多少
l*****9
发帖数: 7
31
如果基因敲除是致死的,RNAi的knock down是个克服办法。
b*******0
发帖数: 125
32
来自主题: Biology版 - Stealth RNAi™ siRNA negative control
哪位大侠有 Stealth RNAi™ siRNA negative control 的序列?
Invitrogen 的 太贵,想自己合成。 多谢!
j********q
发帖数: 1001
33
来自主题: Chemistry版 - Postdoc Position – RNAi Nanotechnology
A postdoctoral position is available immediately for a joint project led by
Dr. Jinjun Shi and Dr. Omid Farokhzad at Brigham and Women's Hospital/
Harvard Medical School. The applicant should have a doctoral degree in
Chemistry, Bioengineering, Pharmaceutical Science, or related field, and a
strong interest in cancer research. The applicant should also be highly self
-motivated and has a track record of creativity and productivity. Experience
with nanotechnology, gene therapy, animal work, and/o... 阅读全帖
c*******g
发帖数: 695
34
来自主题: Pharmaceutical版 - 请牛人指点一下RNAi的发展前途
I think one siRNA drug treat AMD (an eye disease) was approved
But, latter it was discovered that the mechanism is not RNAi
as it original designed to be.
Systemic siRNA drug are not approved yet
k**l
发帖数: 79
35
来自主题: Pharmaceutical版 - 请牛人指点一下RNAi的发展前途
search alnylam in pubmed, they have published many articles together with
Bob Langer from MIT.
Topical administration of RNAi against AMD was proved to be a generic effect
on an article in nature,which is about a whole bunch of toll like receptors.
s********d
发帖数: 103
36
来自主题: Pharmacy版 - Re. RNAi 抗癌药
以前我用过RNAi,一直认为进入细胞及有效抑制性和毒性是两个不可能解决的问题。有
人参与这个Trial吗,给讲一讲。
l******k
发帖数: 27533
37
来自主题: Pharmacy版 - Re. RNAi 抗癌药
有意思~
以前读研的时候还做过RNAi的呢。。。

and
m****n
发帖数: 1066
38
来自主题: Pharmacy版 - Re. RNAi 抗癌药
RNAi这个领域是在低谷。
大药厂撤退了,投资的人也少了,内行的人也很清楚。
中国肝癌发病率高,是个做临床实验的好地方。

abnormal
and
m****g
发帖数: 530
39
来自主题: Science版 - 新型RNAi药物纳米载体 (转载)
【 以下文字转载自 Harvard_Medical_School 俱乐部 】
发信人: macdog (dog), 信区: Harvard_Medical_School
标 题: 新型RNAi药物纳米载体
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Aug 26 21:39:24 2009, 美东)
研究人员在8月在线出版的《自然—纳米技术》期刊上报告,将一种新配方制成的磁性
纳米颗粒用于输送核酸药物,可抑制小鼠肿瘤的生长。他们发现,与采用商业化的纳米
颗粒药物运输器相比,用这种纳米颗粒输送癌症基因沉默因子RNA能更有效地抗击肿瘤
。新发明有望提高针对各种癌症的基因药物发送系统的效率。
癌症基因治疗的成功取决于如何有效地将小型干扰RNA(siRNA)运送到导致疾病的特定
基因,并将它们关闭。Yoshihisa Namiki和同事将携带最优化序列siRNA的磁性纳米颗
粒注入小鼠的血管中,然后通过磁铁引导携带siRNA的纳米颗粒进入肿瘤,这种磁铁粘
贴或是种植在肿瘤附近的皮肤下面。这种siRNA经专门设计,用于沉默肿瘤血管中特定
基因的表达;经过8次最优化剂量的注射后,这种特定的siRNA
K**********r
发帖数: 2640
40
来自主题: _pennystock版 - 谁懂RNAi?
看到ALNY跌的一蹋糊涂,产生几点疑问:
1.它虽然license out不少,pipeline所针对的病也很凶猛,可是到目前为止,它进展
最快的candidate也就停留在phase II。可它家的股价咋一直那么高呢?
2.它的股价目前的价格几乎可以和2005年有一拼了。前两年达到高峰,可自从去年10月
就一直坐滑梯。这是为什么?是因为RNAi技术本身或市场需求的问题,还是该公司自身
的因素所造成的?它家的滑梯要坐到哪里才算头啊。
觉得这两天会有个反弹,但看起来即使反弹也仍然见不到底。。。
h***e
发帖数: 7320
41
来自主题: _pennystock版 - 谁懂RNAi?
说实话我真不觉得rnai技术靠谱,虽然有不少老鼠的model显示出比较positive的结果
,但是想想那玩意off target那么多,肯定临床用的话副作用会很大
虽然热的一塌糊涂,但是个人认为也就是在整个biomedical的临床应用中起到了技术革
新的作用,但从bench到临床,没认真研究过,但可能我比较保守,不太看好它吧
g*********d
发帖数: 233
42
RNA干扰及其在动物繁殖中的应用
2009-12-28
RNA 干扰(RNA interference, RNAi)是生物进化过程中遗留下来的一种在转录后通
过 RNA 调控基因表达的机制, 它是指在真核细胞中引入双链 RNA分子从而导致具有序
列同源性的基因产生特异性基因沉默 (gene silencing)的现象 。由于 RNA干扰可以阻
断特定的基因表达, 具有超越疫苗和抗病毒药物的诸多优点, 因此在阐述基因功能以及
蛋白质相互作用等方面, 表现出诱人的前景。近年来随着分子生物学的发展, RNAi 的
机制也不断被阐明, 同时国内外研究也证实 RNAi 技术可以为动物繁殖过程中所涉及的
基因功能提供一条新的思路, 这在科研和生产实践上都具有重要的意义。
1 RNAi的发现
Matzke 等于 1989 年报道了启动子介导的序列同源性基因共转染烟草可引起转
基因表达发生沉默。 1990 年, Napoli 和 Van der Krol 等为了让矮牵牛花的颜色更
加鲜艳, 把与紫色相关的查尔酮(chalcone)基因转染到牵牛花内, 结果意外发现, 植物
体的颜色... 阅读全帖
t****r
发帖数: 702
43
http://phx.corporate-ir.net/phoenix.zhtml?c=148005&p=irol-newsA
9293&highlight=
没那么夸张,只是phase I study 有效果而已。。。
Alnylam and Collaborators Publish Results from Phase I Clinical Trial and Ex
tension Study with ALN-VSP, an RNAi Therapeutic for the Treatment of Liver C
ancer
- Results Published in Cancer Discovery Document Most Comprehensive Human Ex
perience To Date for RNAi Therapeutics Delivered with Lipid Nanoparticles (L
NPs) -
CAMBRIDGE, Mass.--(BUSINESS WIRE)--Jan. 30, 2013-- Alnylam Pharmaceu... 阅读全帖
f***y
发帖数: 4447
44
http://news.nju.edu.cn/show_article_2_37651
一个偶然的机会,张辰宇将目光瞄准了当时刚刚引起学术界关注的一种小分子核酸物质
——微小核糖核酸(MicroRNA)。并在南京大学生命科学院组建了一支被称作M3的研究
团队,该团队由生命科学、分子生物学、植物生物学、生物信息学、医学、化学等多学
科研究者组成。
在“泡了”三天三夜实验室后,陈熹和导师张辰宇的研究团队,得出了一个突破传统生
物学常识、震惊学术界、国际首发的实验结论,即MicroRNA在人和动物的血清/血浆中
可长期稳定存在。
本报记者王世玲南京报道
未拆包的搬家行李、满屋书籍、屋中间放置着一个脚踏健身器……2014年年底冬日的一
个周日下午,32岁的陈熹正在刚搬入的新办公室里用电脑敲打着最新的科研论文。即便
是周末,跟陈熹办公室同楼层的南京大学仙林校区的生命科学学院实验室内,一群国内
外研究生们仍在紧张地做着实验。
作为南京大学生命科学院最年轻的博士生导师,7年前,当陈熹还是南大博士时,他被
导师张辰宇“逼着”去做一个略显疯狂的生物学想法的实验:去检测人的血清中是否含
有微小核糖核酸(m... 阅读全帖
d****f
发帖数: 313
45
6park上转来的:
http://site.6park.com/chan2/index.php?app=forum&act=threadview&
说实话我真是希望是真的,不过我目前所受的教育似乎尚不允许我相信之:
特大號外
美國公司宣佈人類已經攻克癌症
合成的雙鏈RNA進入肝細胞後,人體內的RNAi機制便會摧毀合成的RNA和任何與之匹配的
、與腫瘤生長相關的信使RNA,阻止蛋白質的繼續產生,從而使腫瘤停止生長....
據美國媒體報導,美國阿爾尼拉姆生物技術公司日前宣佈他們找到了一種能夠治癒所有
癌症的新型藥物,首批接受臨床試驗的19名晚期肝癌患者病情都有較大好轉。不僅如此
,該公司稱,假以時日,這種藥物甚至有可能治癒一切疾病。
首批患者反應良好
今年4月,19名接受化療但沒有好轉的肝癌病人開始服用這種名為ALN-VSP的新型藥物。
服用第一劑後的數周內,藥物就已經很明顯地開始阻止腫瘤產生自身生長需要的蛋白質。
到今年6月,阿爾尼拉姆公司稱,通過“喚醒”人體自身的一種很少使用的免疫防禦
系統,ALN-VSP成功切斷肝癌患者體內腫瘤62%的血流量。在治療肝癌時,傳統藥物一般
使... 阅读全帖
y*****l
发帖数: 5997
46
据美国媒体8月24日报道,美国阿尔尼拉姆生物技术公司日前宣布他们找到了一种能够
治愈所有癌症的新型药物,首批接受临床试验的19名晚期肝癌患者病情都有较大好转。
不仅如此,该公司称,假以时日,这种药物甚至有可能治愈一切疾病。
首批患者反应良好
今年4月,19名接受化疗但没有好转的肝癌病人开始服用这种名为ALN-VSP的新型药
物。服用第一剂后的数周内,药物就已经很明显地开始阻止肿瘤产生自身生长需要的蛋
白质。
到今年6月,阿尔尼拉姆公司称,通过“唤醒”人体自身的一种很少使用的免疫防
御系统,ALN-VSP成功切断肝癌患者体内肿瘤62%的血流量。在治疗肝癌时,传统药物一
般使用消除致病蛋白质的方法,而ALN-VSP则通过核糖核酸干扰(RNAi)疗法直接阻止细
胞生成致病蛋白质。
唤醒人体自身防御机制
科学家在研究中还发现核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)之间一个奇妙的联系—
——如果说DNA对蛋白质来说是一张图纸,那么RNA就是能够下达指令的建筑商。RNA把
DNA上的基因复制成单链的信使RNA,再由它向细胞传递信息继而产生蛋白质。
1998年,科学家发现了核糖核酸干扰(RNAi)... 阅读全帖
b*********f
发帖数: 1585
47
合成的双链RNA进入肝细胞后,人体内的RNAi机制便会摧毁合成的RNA和任何与
之匹配的、与肿瘤生长相关的信使RNA,阻止蛋白质的继续产生,从而使肿瘤停止生长.
...
据美国媒体报道,美国阿尔尼拉姆生物技术公司日前宣布他们找到了一种能够
治愈所有癌症的新型药物,首批接受临床试验的19名晚期肝癌患者病情都有较大好转。
不仅如此,该公司称,假以时日,这种药物甚至有可能治愈一切疾病。
首批患者反应良好
今年4月,19名接受化疗但没有好转的肝癌病人开始服用这种名为ALN-VSP的新
型药物。服用第一剂后的数周内,药物就已经很明显地开始阻止肿瘤产生自身生长需要
的蛋白质。
到今年6月,阿尔尼拉姆公司称,通过“唤醒”人体自身的一种很少使用的免疫
防御系统,ALN-VSP成功切断肝癌患者体内肿瘤62%的血流量。在治疗肝癌时,传统药物
一般使用消除致病蛋白质的方法,而ALN-VSP则通过核糖核酸干扰(RNAi)疗法直接阻止
细胞生成致病蛋白质。
唤醒人体自身防御机制
科学家在研究中还发现核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)之... 阅读全帖
o*****r
发帖数: 109
48
http://ir.arrowheadresearch.com/releasedetail.cfm?ReleaseID=854
Arrowhead Issues a Statement on Intellectual Property Protection for ARC-520
PASADENA, Calif.--(BUSINESS WIRE)-- Arrowhead Research Corporation (NASDAQ:
ARWR), a biopharmaceutical company developing targeted RNAi therapeutics,
today reaffirmed its belief that it has broad access to intellectual
property required to develop ARC-520, its clinical candidate against chronic
hepatitis B infection. The Company has licenses to relevant pat... 阅读全帖
p*****m
发帖数: 7030
49
来自主题: Biology版 - Yamanaka 是不是一个幸运儿
同修 至少等iPS真的用了再说应用行不?呵呵 RNAi刚出来的时候多少人想着从此治病
太容易了呢
如果目前来看,我倒是觉得iPS充其量也就是RNAi这个级别的:一方面有应用潜能;一
方面,是对经典生物理论的小小修正。哦,可能还远不如RNAi,毕竟RNAi是自然界存在
的现象,而iPS可能单纯就是人为创造的现象

只说人,孟德尔算一个,摩尔根算一个,科里森。
学术上的差别没那么大,他们几个人的发现都是对整个生物界都有着重大影响,这种发
现在史上不是太多。其实yamanaka的IPS不仅仅是发现,而是cell engineering。
应用上,这几个人的发现远不如yamanaka了吧?
o*****r
发帖数: 109
50
ARWR 我的蝌蚪fa,YMYD。板上有制药大牛,请发表意见。我跟生物制药没半毛钱关系。
公司40多人,小药股。研究乙肝功能性治愈的ARC-520,市场有多大我就不多说了,中
国就有超过一亿。利用RNAi机制,在黑猩猩实验数据出色。想强调,迄今为止还没有能
搞定乙肝病毒cccDNA的药物,ARC-520也不能。理论是通过降低S抗原唤醒免疫系统达到
功能性治愈。风险怎样,很大。不过利润也是很巨大。
现在ARC-520,通过一期安全人体实验。今年马上香港2期a,单剂实验,下半年2期b多
剂实验。幻想如果整个药品最后成功,类比现在ICPT的市值,ARWR每股要100+。
RNAi最近很火, http://rnaitherapeutics.blogspot.ca/ 关于RNAi药物公司的BLOG我觉得可以多看看。
ARWR还有DPC平台来运送药物到标靶基因。据介绍是最好的一个平台之一。一旦ARC-520
成功,DPC作为平台可以马上拓展产品线。
今天ARWR继续牛市,其实整个大盘今天好多这样。。。
如果稳妥起见,建议等2期a数据出来。如果是好数据,追涨也比较安全,而且涨的余地
也还是够你赚的。... 阅读全帖
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