s******a
发帖数: 472 | 1 研究的inhibitor用DMSO溶解，所以需要DMSO的对照。但是和没有任何处理的细胞相比
，DMSO降低基因A的表达（RT-PCR). 做了一个２个小时的time course，有一个随着
DMSO处理时间增加表达下降的趋势（和无处理组相比）。但是我使用的DMSO浓度远低于
０.５（v/v），据文献报道这个浓度该细胞不应有何影响。细胞在DMSO２个小时后
viability，形态都正常。
另外研究的基因B则不受DMSO影响(RT-PCR）。
DMSO影响基因表达的可能机制都有什么？
欢迎大家指教！多谢！！ |
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s*****g
发帖数: 7857 | 2 DMSO如果时间太长，不是新买的，或纯度不高，就会有这个问题。我当时就坚持称重，
然后再加固定体积的DMSO，然后加热，搅拌。。。。才溶了。
后来我用新买的的高纯度的DMSO，就没有这个问题了，加了固定体积的DMSO进了固定重
量的药物以
后，混匀就溶了。50-100mM stock
当然我的药和你的不同。。。
前面提的建议都正确，但是以后每次都这么测，得多麻烦啊！
实在不行，用酒精试试。 |
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F********y
发帖数: 306 | 3 楼主用DMSO洗就是最大的错误，你要知道币洗没洗干净无所谓，关键DMSO渗透力超强，
最好少沾。
再说币差到要用DMSO洗，考虑不周
得罪了：） |
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b*****m
发帖数: 438 | 4 【 以下文字转载自 Biology 讨论区 】
发信人: bigworm (不要搞错,是老虎!), 信区: Biology
标 题: DMSO会氧化cysteine残基吗?
发信站: BBS 未名空间站 (Wed Sep 25 19:06:41 2013, 美东)
想做个膜蛋白的substituted cysteine accessibility实验(用sulfhydryl reagent),
想把几个主要试剂(hydrophobic)溶在DMSO中. 但是DMSO (Dimethyl sulfoxide)会不会
氧化cysteine残基呢？用Dimethylformamide (DMF)做溶剂能否解决这个问题？
谢谢 |
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b*****m
发帖数: 438 | 5 想做个膜蛋白的substituted cysteine accessibility实验(用sulfhydryl reagent),
想把几个主要试剂(hydrophobic)溶在DMSO中. 但是DMSO (Dimethyl sulfoxide)会不会
氧化cysteine残基呢？用Dimethylformamide (DMF)做溶剂能否解决这个问题？
谢谢 |
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h*******l
发帖数: 16 | 6 先要测一种药物对细胞基因表达的作用，要把药物加到细胞培养液中去。这是一种
非水溶性药物，可以溶解在DMSO里面，但是溶解度也不高。需要用DMSO配置固定浓度的
STOCK SOLUTION(10^-5 M).又是加热又时sonicate，好不容易总算是把药物溶进去了。
但是不确定是不是达到目标浓度了。请问有什么方法可以确定溶液的浓度呢？谢谢！ |
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m*********D
发帖数: 1727 | 7 GC-MS。你的DMSO溶液成分单一，很好测的。MS是根据分子量来检测的。需要standard
solution，就是作标准曲线用。应该不需要你提供，检测的地方会自己准备。你只要交
一定量的DMSO溶液，人家可以根据需要来处理的。很多大学的facility就可以。 |
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h***e
发帖数: 20195 | 8 本来只想清洗一下油脂的，结果忙其他事情忘了，超了很长时间导致温度升高，应该是
DMSO高温下起了氧化作用，两个币变黑黄玩完了，500刀就这样完了 |
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h******s
发帖数: 802 | 9 为什么用DMSO？我都用ACN和水和0.1%的FA超。 |
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h***e
发帖数: 20195 | 10 我是飞来横祸，本来币很好的，最差也得67，自己鬼迷心窍想再洗洗干净，而且先水洗
，然后丙酮洗，最后自己发疯了，又用DMSO洗，结果温度一高洗出问题了 |
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c******n
发帖数: 16403 | 11 洗油脂用hexane就行了， 干嘛用dmso啊 |
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c******n
发帖数: 16403 | 12 DMSO里有硫， 说不定是硫化银。 估计都得要用那个FA来搞了。 |
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h****7
发帖数: 1405 | 13 以二甲亚砜(DMSO)作氧化剂，在碱性条件下可将醇选择性地氧化成醛酮 |
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y*k
发帖数: 90 | 15 （三）、组织细胞的保存：
为了防止因污染或技术原因使长期培养功亏一篑，考虑到培养细胞因传代而迟早会出现
变异，有时因寄赠、交换和购买，培养细胞从一个实验室转运到另一个实验室，最佳的
策略是进行低温保存。这对于维持一些特殊细胞株的遗传特性极为重要。现简要介绍深
低温保存法(－70℃—－196C)的特点。
细胞深低温保存的基本原理是：在－79C以下时，细胞内的酶活性均己停止，即代谢处于
完全停止状态，故可以长期保存。细胞低温保存的关键，在于通过0C-20C阶段的处理过
程。在此温度范围内，水晶呈针状，极易招致细胞的严重损伤。用电镜观察，可见细胞
的核膜上有大量针尖样小孔。
生化研究发现，在此温度范围内，钾离子和钠离子集聚在细胞两侧，具有细胞毒性。因
此，为了避免0C——20C冰晶的形成和细胞膜两侧离子平衡的破坏，需要加保护剂。目前
常用的保护剂有甘油和二甲基亚矾(DM50)，它们可降低冰点，在缓慢的冻结条件下，能
使细胞内水分在冻结前透出
细胞外。贮存在-130C以下低温中能减少冰晶形成，DMSO和甘油对细胞无毒性，分子量小
，溶解度大，易穿透细胞，使用浓度范围为5％—15％， |
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M*****n
发帖数: 16729 | 16 why not?
DMSO is not so toxic. |
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a******y
发帖数: 63 | 17 Less than 10% of DMSO should be fine for injection. BTW, 20% of Tween 80 or
Tween 20 may also be included. |
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k******0
发帖数: 1073 | 18 如题。
做蛋白质和小分子的binding，小分子溶在DMSO里。谢谢指导意见。 |
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s*******e
发帖数: 1010 | 19 case by case, need test to know but most proteins won't hate DMSO at low
concentration. |
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k****o
发帖数: 589 | 20 一般来说没大问题的，只要你不是用这浓度的DMSO去处理细胞。 |
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I***a
发帖数: 13467 | 21 用DMSO 诱导后的HL－60 细胞，想做一点neutrophil 的功能，
我觉得这样的数据可能不会被接受，
最后可能还是要用真的neutrophil来做，
但是老板blabla说了一大堆，一句话就是这样先做者，
有没有了解这个东西的？ |
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A******y
发帖数: 2041 | 22 You do know DMSO is the original HDAC inhibitors. |
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j******i
发帖数: 939 | 23 DMSO是有名的活性氧ROS清除剂 这也是种可能性吧 |
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g*********5
发帖数: 2533 | 24 DMSO Promotes the erythroid differentiation of MEL cells |
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r***e
发帖数: 2539 | 25 DMSO一般是还原剂吧，antioxidant. |
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p****u
发帖数: 239 | 26 DMSO oxidizes cysteine in peptide! |
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p****u
发帖数: 239 | 27 For Cys-containing peptides, use DMF instead of DMSO. |
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b*****m
发帖数: 438 | 28 DMSO浓度高到多少就会oxidizes cysteine in peptide? |
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A******y
发帖数: 2041 | 29 If it has certain absorbance or florescence that you know, you can use that
to determine the solution concentration. A drug that can only dissolve in
microM concentration in DMSO, it is a useless drug. You won't be able to
get into human at all though. |
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M******n
发帖数: 508 | 30 取一定量该药物的饱和DMSO溶液让其挥发了称重？ |
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y*****s
发帖数: 1047 | 31 the bp of DMSO is too high...
standard |
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m*********D
发帖数: 1727 | 32 我不是作这行的。以前给人家当下手，作过农药残留。可不可以先真空干燥去掉DMSO,
再用合适的容剂来溶解？ |
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A******y
发帖数: 2041 | 33 If you have a freeze drier, you can pull off DMSO by adding some water to
the solution. |
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S********o
发帖数: 368 | 34 如果compound不易挥发的话,直接放真空干燥箱就好了吧
dmso的vapor pressure很高的 |
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b*****m
发帖数: 438 | 35 DMSO浓度高到多少就会oxidizes cysteine in peptide? |
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k****x
发帖数: 2751 | 36 当年我的peptide是溶解在DMSO中的，因为氧化，换DMF了。 |
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p*****x
发帖数: 68 | 37 the thing is we are using a mixture solvent of DMF and DMSO
thanks |
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b**s
发帖数: 589 | 38 Poly(methacrylic acid)
Poly(acrylic acid)
I guess
because DMF and DMSO are both their good solvents
I think you might calculate th solubility parameters of solvent and polymer,
make sure they match.
check out http://www.polysciences.com/ you will get some polymer standard
information |
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i***y
发帖数: 190 | 39 is LiBr necessary for all measured (DMF/DMSO soluble) polymer? |
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y***j
发帖数: 11235 | 40 当然要想，但是生物学家更多的应该注重在生物本身问题，说了很多次一个人的精力是
有限的。不能所有细节都要去研究。就像一个厨师需要很仔细的去想氯化钠的提炼精制
过程么？
我的point是说我们在想，但是只是不去想那些旁支末节的东西，而你就因为我们没有
想这些至少我们认为是旁支末节的东西，而认为我们是缺乏思考。当然如果你说的学生
，就是专业标记蛋白的那又是另外的故事了。
另外，您有没有注意，很多的kit是不标明具体成分的，我们想思考一下，都没有办法
思考。
我们实验室经常自己用荧光标记抗体，所有人拿过来kit就用，从来没出现过问题。如
果就算出现了问题，我们也就是去找公司，我们买了kit，得到相应的技术支持是应当
的，这种化学方面的技术性问题不是我们应该花大力气去研究的，我们的思考重点应该
放在别人无法替我们做的东西。
当我们的大量的结果最有效的方法就是直接扔去生统系去算。我个人对生统比较感兴趣
，所以也算学的很深入，但是我知道，会对我的实验有些帮助，但是不是本质上的。因
为很多还是力气活，我替他们干了，也就是文章最后少写一个他们的名字。
另外，我受的本科教育也是半年无机，一年有机，一年生物... 阅读全帖 |
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q******g
发帖数: 3858 | 41 我有个一个化合物溶在DMSO里。高浓度下在PBS或media里都产生沉淀。现在想做动物试
验，我准备把它打入小鼠体内(100ul), 对照组打100ulDMSO. DMSO的量是不是太多了？
好像DMSO也可以抑制细胞生长。谁能给个建议，用其他什么溶剂比较好啊？谢谢了 |
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T**y
发帖数: 673 | 42 DMF or DMSO: Very polar and high-boiling solvents that are difficult to
remove. If your product is not dangerously polar, dilute with lots and lots
of water before extracting with a nonpolar solvent. Then thoroughly wash the
organic layer with water.
For 5 mL of DMF or DMSO, use 5 X 10 mL of water during the aqueous wash.
This should remove all of the DMF or DMSO |
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c**i
发帖数: 6973 | 43 You say, "你跟本不用查找专业文献，反渗透膜是porous 的高分子材料，有点高分子
物理知识的人都知道温度降低，高分子链的热物理性能和构型会发生改变，这样膜的孔
径就会收缩，透水率就会明显降低."
In the primary school, we learn that if we heat a metal with a hole, the
hole will be bigger. Search the Web, with the terms (metal hole heat).
What is used in reverse osmosis (RO) is not metal but polymer. Thus there is
nothing intuitive about how pore will behaves. Indeed emperically there are
two types of pores in a RO membrane.
(1) That temperature affects membrane permeability is a fact. ... 阅读全帖 |
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G******i
发帖数: 5226 | 44 ☆─────────────────────────────────────☆
dodidoes (joni) 于 (Fri Jun 17 01:12:49 2011, 美东) 提到:
6月9日毕业，3月15日就把OPT的申请递交了。然后我就用CPT的身份工作到现在，结果
快到6月9日了，OPT的审批状态还一直是initial review. 在此之前我办了2次加急，移
民局的人要我在公司把我的工作OFFER LETTER传真过去，我传了2次，人家收了之后就
再也不理我了。每次打电话过去都说不知道，让人干着急。眼见cpt马上到期了，公司
又正准备裁员，HR说了不太可以给我保留职位.在最后的一周，我实在没办法了，就想
申请延期到暑假毕业，这样就可以把CPT延期，倒是要把OPT撤销回来，重新申请（因为
毕业时间已经改了）.结果给移民局发了信，一周没消息。OPT状态仍旧是initial
review。于是我就放弃了，打算不延期毕业了，把之前撤销OPT的信再撤销回来，这事
是学校的研究生院的人帮我办的。我根本联系不上移民局的人。学校研究生院的说已经
帮我把那封撤销信撤销回来了，还说如... 阅读全帖 |
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l*****e
发帖数: 8596 | 45 这个周末研究了一下新鲜breast milk的营养，抗炎，和免疫价值，才发现这一冻可是
损失了不少。奶不仅是娃的粮食，提供热量和长身体的原料，新鲜奶里的白细胞，溶菌
酶，可以直接杀菌消炎；抗体可以帮助免疫；还有其他有益的冬冬。这一冻，活的白细
胞们都完蛋了，抗体们如果冻不好也会灭活，或者粘容器上。姐妹们来讨论下如何冻才
能最好的保持鲜奶的益处？
热量和长身体的原料应该不受冷冻损害。
实验室有-80的冰箱，用来冻蛋白质，所以放在家用-20的冰柜里抗体和酶应该损失不大。
想保留活的白细胞们就比较难。要先加DMSO,然后用基本绝热的容器经过一昼夜慢慢慢
慢降温到-24，然后移到液氮里，化冻的时候还要迅速升温到37。这样子细胞们能有50%
活过来。家里冻奶，首先不能加DMSO,然后也没有液氮。-20的冰箱倒是可以，买个套子
慢慢降温不怕麻烦也还可行。快速解冻也比较难，除非冻成很小的体积，或者很薄的片
状，可这样又会增加容器表面吸附。难。
技术贴。欢迎懂行的来支招。 |
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n********k
发帖数: 2818 | 46 google is ur best friend...anyway, in general, it is denature reagent and/or
detergent including DMSO, Betaine, NP40, Triton-X100 etc etc...what I heard
Betaine is likely the best for most of application...and u can buy it from
some company...nonetheless, it could still be tricky even if you know the
gradient, it could still take a hell a lot effort to figure out correct
composition...I personally have used mostly DMSO, and Q solution from qiagen
and a bit betaine... |
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a******n
发帖数: 167 | 47 嗯，支持DMSO。这么短的片段，加点DMSO应该work，也不怕多少突变。 |
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h**********r
发帖数: 671 | 48 试试
1）Pfx的Enhancer buffer
2)加DMSO
3)试试Phusion的GC buffer或加DMSO |
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d***3
发帖数: 181 | 49 My suggestion:
For in vitro cell-based assays, use the free base and make a stock in DMSO.
For in vivo studies, use the HCl salt without DMSO. |
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p*****r
发帖数: 64 | 50 谢谢上面几位的建议. 我也试过用paper towels,但384板上不是每个孔都平均的去掉
medium,所以不行.而且每次靠手来控制力度的话,差异更大. ABI 基本上没什么建议.
如果加一个板子的话,靠人还行,要是加100个板子,根本不可能做到.
做high-throughput screen, 我现在的确是看delta-delta C(t) right, 理论上不担心
每个孔出来到值,但是在284板子上,要用32个positive control 和32个DMSO 做Z
fanctor分析.这样的话,positive control 和DMSO组内的差异必须很小才行.所以只有
组内每个孔细胞数基本一直才行.
还有就是用qPCR 做screen的确耗钱,但现在是花了钱,也不能保证稳定. 真是麻烦阿. |
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